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公司注销营业执照的费用因地区、公司类型、工商部门收费标准和公司具体情况而异。一般来说，注销公司的费用包括多个方面，如工商注销费用、税务注销费用等。至于注册资金为1000万元的公司注销营业执照的费用，无法直接给出具体金额。

建议咨询当地工商局或相关服务机构，以获取准确、具体的费用信息，还要关注公司是否有遗留问题，如债务、税务等，这些都可能影响注销的费用和时间，确保在注销前处理好所有相关事宜，以避免不必要的麻烦和费用，公司注销涉及多个环节和因素，建议咨询专业人士以获得更准确的指导。